Если вы выбрали в качестве виртуальной машины VirtualBox, предлагаю установить небольшой апплет на панель уведомлений. С помощью нее вы сможете запускать как саму программу VirtualBox, так и любую виртуальную машину без запуска самого VirtualBox-a. Пока никаких настроек нет, они в принципе не нужны. На сегодняшний день актуальная версия 1.1.

Для установки необходимо добавить репозиторий:

sudo add-apt-repository ppa:michael-astrapi/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install indicator-virtualbox

Запустить можно через Alt+F2 – indicator-virtualbox или в меню Приложения – Системные утилиты – Индикатор для VirtualBox. А еще лучше добавить в автозапуск команду indicator-virtualbox.